清代官方文獻上，對于八旗的排序，在入關(guān)之前和入關(guān)之初，進行了數(shù)次修改。
在史料上，第一次見到八旗的排序，是《滿文老檔》天命七年四月份，排序為：1.正黃旗。2.鑲黃旗。3.正紅旗。4.鑲紅旗。5.鑲藍旗。6.正藍旗。7.正白旗。8.鑲白旗。
當時，正黃旗、鑲黃旗的旗主，都是太祖本人。
兩紅旗，旗主皆為禮烈親王代善，代善在太祖長子褚英被殺后，實際上成為門長，故而他的兩個旗排在第二位。
鑲藍旗的旗主阿敏，是舒爾哈齊的兒子，太祖的侄子，排在第三位。
正藍旗的莽古爾泰，是太祖的兒子，比鑲藍旗的阿敏小一歲，故而排在第四。
正白旗的旗主，是后來的太宗，太宗是太祖的第八子，所以排在哥哥和堂兄的后面。
最后鑲白旗的旗主是杜度，是褚英的兒子，也是幾個旗主的孫子或者侄子，故而排在最后。
到了《滿文老檔》天命八年六月十八日和天命十年的時候，余下六旗沒有變動，但是鑲黃旗取代正黃旗成為了“頭旗”。
這實際上是因為，在太祖末年，太祖將兩黃旗，逐步分給三個幼子，即阿濟格、多爾袞、多鐸。所以最后導致自己親領的旗分，只有鑲黃旗的一部分。
故而，此時居首的旗，自然是鑲黃旗。類似這樣的變化，在清代入關(guān)之前還有好幾次。
直到世祖順治朝中期，八旗的排序才正式確定，而且直到清末，再也沒有變動過。
所以我們看清代的史料，如《東華錄》、《八旗通志》、《清史稿》等等，對八旗的排序皆為：1.鑲黃旗。2.正黃旗。3.正白旗。4.正紅旗。5.鑲白旗。6.鑲紅旗。7.正藍旗。8.鑲藍旗。
正因為這種官方的排序中，鑲黃旗一直都作為八旗之首，所以，在清代，有一個專用的名詞來稱呼鑲黃旗，即“頭旗”。
這種格局，實際上也是在尊崇皇室的前提下，對血緣次序的一種尊重。我們看，鑲黃旗、正黃旗、正白旗同屬上三旗，由于兩黃旗被皇室統(tǒng)帥的時間最長，故而居首。
正紅旗的旗主是禮烈親王代善，是太祖實際上的大宗（門長），在宗室中地位最高，故而作為下五旗之首。
鑲白旗的旗主是肅武親王豪格，是太宗的大宗，同為大宗，又是世祖的長兄，作為和皇帝血緣最近的旗，排在太祖大宗正紅旗之后。
鑲紅旗是禮王的支流，緊隨其后。
正藍旗實際上是睿王多爾袞、豫王多鐸的遺領，作為太祖的直系后人，排在大宗之后。
而鑲藍旗旗主濟爾哈朗，一來是由于血統(tǒng)稍遠，二來是由于經(jīng)歷過舒爾哈齊、阿敏兩次懲罰，作為太祖兄弟的后裔，排在了最后一位。
