1、赤井秀一
代號：黑麥威士忌
實際身份為臥底在黑衣組織里的FBI搜查官。
2、沙朗.溫亞德
代號：貝爾摩德
目前身份成謎，雖為黑衣組織成員，但似乎并未真正敵對柯南等人。
3、代號：基安蒂
黑衣組織狙擊手，然而到目前為止，并沒有什么卵用……
4、代號：科恩
黑衣組織狙擊手×2，沒什么卵用×2
5、安室透
代號：波本
呵呵呵，這么帥氣的人怎么可能是反面角色，安室透真實身份是潛伏在黑衣組織里的公安警察…
6、廣田雅美
化名：宮野明美
真是身份是灰原哀的姐姐，F(xiàn)BI赤井秀一的前女友，后被琴酒槍殺。
7、宮野志保
代號：雪莉
化名：灰原哀
黑衣組織里的科學家，柯南和她自己所服用的毒藥APTX-4869就是她所研制，后成為叛徒逃離組織。
8、本堂瑛海
代號：基爾
化名：水無憐奈
真實身份，CIA派來的臥底……
9、代號：庫拉索
這個更搞笑了，就在劇場版中出現(xiàn)了一下，不僅完全被小朋友們帶節(jié)奏，還分分鐘被小朋友們策反了……
10、伏特加
琴酒的跟班，算是最忠實的黑衣組織成員了吧，然而成事不足敗事有余啊……
其他成員：
皮斯克，死亡
龍舌蘭，死亡
卡爾瓦多斯，死亡
宮野厚司，死亡
宮野艾蓮娜，死亡
楠田陸道，死亡
沼淵己一郎，被捕
伊森本堂（CIA)，死亡
原佳明，死亡
愛爾蘭，死亡
岡倉政明，死亡
（太悲催了，我都不好意思繼續(xù)寫下去了……）
司陶特，死亡
阿夸維特，死亡
威士蓮，死亡
阿拉克，死亡
朱乃瑞克，脫離組織
……………………
黑衣組織的成員分為三中，成員，背叛和臥底。
BOSS烏丸蓮耶，一個消失的大富翁。朗姆，組織的第二把交椅，殺了羽田浩司后，成了一只義眼。琴酒灌藥給柯南的人，經常追殺雪莉和臥底。伏特加，琴酒的小弟。龍舌蘭在一次和滿天堂交易時被炸死。皮斯科，發(fā)現(xiàn)雪莉變小的秘密。愛爾蘭，劇場版中發(fā)現(xiàn)了新一的真實身份，最后被琴酒滅口。楠田陸道一個連代號的都沒有，最后被逼到舉槍自殺，尸體還成為了赤井秀一的替尸。科恩和基安蒂是狙擊手，經常和貝爾摩德吵架。
貝爾摩德又叫苦艾酒，一個身在曹營心在漢的成員，看透水無憐奈的身份卻不說。庫拉索，原本是要盜取資料，結果失憶后被小孩子感化了，最后為了救孩子死了。雪莉，姐姐被殺后直接服毒變成小孩子。
臥底：赤井秀一，降谷零，諸伏景光，水無憐奈，伊森本堂，
